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十七年（1644年），勤王军退兵后获举荐入授监察御史，尚未赴任，流寇张献忠部已攻破江西袁州、吉州，转攻赣州以窥探福建；毛协恭对张肯堂进言：「杉关，入闽门户，关固，贼不能越邵武而南。请厚集兵守之。」两个月后，张献忠军转往四川使福建危机暂解，而李自成攻陷京师畿辅西侧地带，崇祯帝下诏勤王，毛协恭与张肯堂再度募集义勇军，刚集结便获悉京师沦陷皇帝殉国。南明福王监国，授为陕西道监察御史。
隆武元年（1645年，顺治二年）闰六月隆武帝称帝后，以御史提督福建学政。
隆武二年（1646年，顺治三年）正月，毛协恭进呈常州同乡各臣书疏，隆武帝读完感到悲痛，说：「江南士绅，无人不洒涕思明，枕戈待举。朕必亲提黄钺，张皇六师，以慰臣民之望。大小文武，当时时刻励尔志，毋狃偏安！」
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染色质免疫沉淀-测序（ChIP-sequencing，简称为ChIP-seq）被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀（ChIP）与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前，ChIP-on-chip是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。
ChIP-seq主要用于确定转录因子和其他染色质相关蛋白质如何影响表型影响机制。确定蛋白质如何与DNA相互作用来调控基因表达对于充分了解许多生物过程和疾病状态至关重要。这种表观遗传信息与基因型和表达分析是互补的。 ChIP-seq技术目前主要被看作是需要杂交阵列的ChIP-on-Chip的替代品。 这必然会引入一些偏差，因为一个阵列仅限于有固定数量的探针。相反，尽管不同测序技术的测序偏差尚未完全了解，测序被认为偏差较小。
与转录因子和其他蛋白质直接物理相互作用的特定DNA位点可通过染色质免疫沉淀被分离出来。 ChIP产生在活体内In vivo兴趣蛋白质结合的目标DNA位点文库。 大规模平行序列分析与全基因组序列数据库结合使用来分析任何蛋白质与DNA的相互作用模式或任何表观遗传染色质修饰的模式。 这可以应用于一系列ChIP蛋白和修饰，如转录因子，聚合酶和转录机制，结构蛋白质，蛋白修饰和DNA修饰。 作为对特异性抗体依赖性的替代方法，已经开发了不同的方法来发现基因组中所有核小体耗尽的(nucleosome-depleted)或核小体扰动(nucleosome-disrupted)的活性调控区的超集，如DNase-Seq和FAIRE-Seq。
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HA集群实现试图在集群中建立冗余以消除单点故障，包括连接多个网络，以及通过存储区域网络冗余连接一些数据存储。
HA集群通常使用心跳专用网络连接，用于监视集群中每个节点的健康状况和状态。所有集群软件必须能够处理的一个不明显但严重的情况是脑裂问题，这种情况发生在所有专用链路同时中断，但集群节点仍在运行时。如果发生这种情况，集群中的每个节点都可能会错误地判断其他节点已经停机，并尝试启动其他节点仍在运行的服务。重复服务实例可能会导致共享存储上的数据损坏。
HA集群通常也使用仲裁见证存储（本地或云）来避免这种情况。见证设备无法在裂开后的集群的两半之间共享，因此，在所有集群成员都无法相互通信（如心跳失败）的情况下，如果某个成员无法访问见证，该设备将无法激活。
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